Перуниката притежава отхрачващо, болкоуспокоително и противовъзпалително действие. Това се дължи на съдържащите се в билката етерично масло, слизести и дъбилни вещества.
Народната медицина я употребява при кашлица, бронхит, възпаления на стомаха и червата и пр. Билкарите я препоръчват още и при задух, стомашни и чревни колики, като успокоително средство и пр.
Външно лековитото растение се използва за жабурене при зъбобол и за гаргара при болки в гърлото.
Използваемата част са коренищата, които се изваждат през есента, в периода септември – декември. Срокът на годност на изсушените корени е 3 години
Употребяват се под формата на запарка, като 1 ч. л. от сухата дрога се поставя в 0,5 л вряла вода. Това е дозата за един ден.